文库细胞名称 | SGRNA数量 | 细胞数 | 覆盖乘数 |
---|---|---|---|
GP2d-Human CRISPRko Library-Drug Targets | 4652 | >2.5*10^6 | 500x |
1. 质控指标:文库覆盖率需>98%,基尼系数<0.1,避免sgRNA分布偏差。
2. 感染参数:推荐MOI=0.3,细胞覆盖度≥300x(全库可200x)以减少传代噪声。
3. 数据分析:建议测序深度≥300x,采用MAGeCK算法筛选显著基因。
4. 验证步骤:结合KO细胞和功能实验(如流式、药物处理)确认靶点。
干冰运输:
温度≤-70℃(干冰填充量≥5kg/24小时)。
长期储存温度:
液氮气相:-150℃至-196℃(推荐长期保存,避免细胞活性下降)。
超低温冰箱:-80℃(仅限短期保存≤6个月,适用于备用样本)。
研美生物MyScreen产品线采取自主研发的BCP技术(Best Cell Pool)来制备高质量的 CRISPR 文库细胞,其技术优势显著,具体如下:
1. 精准的 sgRNA 文库设计:运用全基因组 sgRNA 设计平台,综合考虑 GC 含量、切割位置、序列二级结构、gRNA 特异性等多种因素,设计出编辑效率高且脱靶效应低的 sgRNA 序列,确保每个基因都能被精准地敲除或激活,为后续的基因功能研究提供可靠基础 。
2. 高保真的 sgRNA 合成与文库构建:采用全基因组 sgRNA 合成平台,以低突变率的核酸芯片合成技术合成 sgRNA 文库,保证文库的正确率和覆盖度,从而确保文库质量,减少因突变导致的实验误差 。
3. 高效的慢病毒包装与感染:利用慢病毒包装及稳转细胞系构建平台,通过优化病毒包装条件和转染流程,获得高滴度的慢病毒颗粒,实现对细胞的高效感染,使 sgRNA 和 Cas9 基因能够稳定地整合到细胞基因组中,确保基因编辑的稳定性和持续性 。
4. 严格的质量控制与检测 :在文库构建过程中,经过严格的 NGS 测序分析检测文库的覆盖度和均一性,确保MOI<0.3的情况下覆盖率>98%,所获得的文库细胞基尼系数<0.1,以保证文库的质量和筛选结果的可靠性。
研美生物 MyScreen 产品线凭借其精准的设计、高保真的合成、高效的包装与感染以及严格的质量控制等技术优势,能够制备出高质量的 CRISPR 文库细胞,为基因功能研究和药物研发等领域提供强大的技术支持和可靠的实验工具。
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